Можно на самом деле так сделать, так как аванс закрыт этим же кварталом, налоговая не должна к этому придраться.
Но тем не менее правильно, если по нормативным правилам ведении книги покупок и продаж, нужно взять НДС с аванса, затем провести реализацию и затем провести корректировочную запись по выданному авансу… Но первый вариант надежнее мне кажется.
аванс, если он правильно отражен в разделах 9 и 3 декларации, никак не мог повлиять на расхождение выручки по НДС и по налогу на прибыль.
возможны варианты:
вы отразили аванс в книге продаж с КВО 02, а дальнейшую реализацию в счет этого аванса с КВО 01 не показали. Соответственно, в листе 03 в налоговой базе с сумм реализации этой реализации нет, а в декларации по налогу на прибыль есть. Нужно сдать уточненку , добавить в книгу продаж операцию с КВО 01 и взять НДС с аванса на вычет, соответственно изменится раздел 03
у вас какие-то другие причины расхождений, никак не связанные сэтим авансом