Заем от иностранной организации

Добрый вечер! Пожалуйста, помогите: получен на расчетный счет заем рублевый от иностранной организации сумма больше 3 млн.Нужна ли регистрация договора?

Вы имеете в виду регистрацию контракта в банке (постановка контракта на учет)? Или какую-то другую регистрацию?
Импортный контракт или кредитный договор нужно поставить на учет, если сумма обязательств по нему эквивалентна 3 млн руб. и более. Об этом говорит Инструкция Банка России от 16.08.2017 N 181-И N 181-И

Да, в банке. Спасибо Вам большое! Все ответы в этой инструкции есть.