Запись в ТК

Ген. директор и учредитель ООО в 1 лице. ООО ликвидировано ИФНС № 46 в связи с прекращением юридического лица (исключение из ЕГРЮЛ недействующего юридического лица). Как лучше сделать запись в ТК по собственному или в связи с ликвидацией? И какой номер статьи будет по собственному и в связи с ликвидацией?

Ваш вопрос очень странный.
У вас генеральный на работу вообще принят?
А приказ какой был о его увольнении? и на основании чего? вот какой приказ был - так и делайте. А если вы даже номер статьи по собственному не знаете какой вписать - страшно советы давать вам…

Если суда не было, Вас не объявляли банкротом,получается, что Ваше ООО не ликвидировано, а значит, вполне возможно, по моему мнению, увольнение по п.2 ст.278 ТК РФ.