3ндфл физ лицо и ИП

Добрый день. В сентябре 2019 г. закрыла ИП на ОСНО, декларацию подала, ндфл уплатила. В ноябре купила квартиру, а в марте 2020 подала заявление на возврат 13% (работала наемно) и декларацию 3ндфл о покупке жилья.
Вчера открыла личный кабинет физ лица, камералку провели, сумму подтвердили, но возвращать не хотят, ссылаясь на какие-то переплаты у ИП. Зашла в личный кабинет ИП, висят переплаты налога, декларация принята. В чем может быть проблема?
Может быть надо в 3ндфл физ лица еще дополнительно повторно учесть деятельность ИП за 2019 г?

Да, конечно. Надо было подавать корректировочную декларацию за 2019 год, где указывать доходы и от предпринимательской деятельности
А вы вычет по НДФЛ из каких доходов заявили?

Было приобретение квартиры, декларация заполнилась автоматически на сайте налоговой, в личном кабинете. Поэтому и вопросов не возникло. Более того ип закрыто с сентября 2019 г.,был расчёт что уже никак с физ лицом предпринимательство не пересечется.

Так по каким доходам вы вычет-то тогда заявили?
Как может не пересечься расчет, если декларация 3-НДФЛ может быть только одна за год? По другому не бывает. Корректировку надо было сдавать