Здравствуйте, Павел Владимирович!
Если нет долгов по налогам, зарплате, перед поставщиками, нет незавершенных судебных дел, то самый простой способ ликвидировать ООО - в добровольном порядке.
Участники ООО должны провести собрание, принять решение о добровольной ликвидации, назначить ликвидатора. Этим же решением надо прекратить полномочия умершего директора ООО - назначая вместо него ликвидатора. Если в уставе ООО предусмотрена ликвидационная комиссия, то назначается ликвидационная комиссия и ее председатель.
Дальше уже ликвидатор (председатель ликвидационной комиссии) подает документы для внесения записи в ЕГРЮЛ, делает все необходимые публикации (Вестник госрегистрации и Федресурс), сдает отчетность (в т.ч. оплачивает штрафы за несданную отчетность).
По истечении установленного срока (не менее 2 мес. с момента публикации) рассматриваются требования кредиторов (если такие будут), утверждается ликвидационный баланс (собранием участников) и подаются документы для госрегистрации завершения ликвидации.
Срок добровольной ликвидации - не более года.