Сторно задолженности по взносу в уставный капитал

Из вашего поста видно, что у вас деятельность велась. Т.е. фирма не нулевка.
Если есть возможность, то оформила бы приходник на поступление денежных средств (потом их в подотчет) или имущества (которое списать) на размер УК.
НО это так - рассуждения, т.к. сначала надо узнать, что и как скажут делать юристы. Все таки это связано с уставными документами.