Здравствуйте!
Этот вопрос налоговой инспекции не имеет никакого отношения к возможным ошибкам.
Они сравнивают начисленную заработную плату с некой среднеотраслевой заработной платой, и если у вас средняя зарплата получается меньше, то спрашивают.
Вот аналогичный вопрос был: Как ответить на требование