Добрый день.
1-2. Беспроцентный заём можно выдать любому лицу, а не только работнику организации. Учредительство же вообще роли не играет. Но надо смотреть в устав, есть ли там требование по крупным сделкам - согласовывать их с учредителями. Если есть, то заключение такого договора, если сумма сделки будет крупной, потребует письменного разрешения учредителей.
3-4. При выдаче и возврате займа ККТ не надо применять. По займам применяют ККТ только финансовые организации, для которых займы - предпринимательская деятельность.