НДС при переходе на УСН

Наша организация планирует переход на УСН в 2021 году.
Так же планируем заключить договор в 2020 на выполнение работ. Закрытие будет осуществляться в 2020 году и часть в 2021 году.
Скажите как начислять НДС? в 2020 сумма работ с НДС, а в 2021 году без НДС? тогда как поступить с договором в котором вся сумма работ с ндс? или необходимо выставить по этому договору счет-фактуру по закрытию в 2021году?
Спасибо!

Работы сданные в 2020 с НДС, работы, сданные в 2021 без НДС и никаких счетов-фактур
Пропишите в договоре стоимость сразу без НДС (с припиской, что НДС начисляется сверх цены, если применим)

Но у нас госконтракт, и НДС будет прописан в договоре изначально. С госорганами не договориться о том, как надо прописать НДС в договоре изначально.