Отражение 0 ставки по НДС

В августе месяце 2021 года была произведена отгрузка во Францию на сумму 3 млн. руб, отражена она в 4 кв 2021 г в книге продаж с 0 ой ставкой НДС, но не был создан 4 раздел… Ставка подтверждена реестром таможеннных деклараций 25.01.2022 (что не более 180 дней), но налоговая инспекция говорит о том, что подтверждение ставки было направлено не в том формате и она нигде в базе ФНС не зарегистрирована, хотя подтверждение получения отправленных файлов имеется. Налоговая требует оплатить НДС с этой реализации.

Добрый день.
Если ФНС не находит подтверждения ставки 0% (реестра таможенных деклараций), то есть два варианта:

  1. доказывать своевременную отправку реестра: квитанция об отправке, о приемке, подтверждение от оператора и т.п., чтобы выяснить, на каком этапе реестр не попал в базу.
  2. если доказать своевременную отправку реестра проблематично, отправлять его заново, в нужном формате. И снова подавать 4 раздел.
    К сожалению, если ставка 0% не подтверждена за 180 дней, на 181 день полагается заплатить НДС по ставке 20%. Но в соответствии с абз. 2 п. 9 ст. 165 НК РФ, если по не подтвержденному за 180 дней экспорту налогоплательщик представляет впоследствии документы, обосновывающие применение ставки 0 %, уплаченные суммы налога подлежат вычету в порядке и на условиях, которые предусмотрены 171 и 172 НК РФ. Вернуть НДС по декларации сейчас можно в ускоренном, заявительном порядке (пп. 8 п. 2, п. 2.2 ст. 176.1, Федеральный закон от 26.03.2022 N 67-ФЗ).
    Но пени избежать не удастся.