Ответ на требование по 6-НДФЛ за периоды более 3 лет

Мягко скажем, ссылка на статью 88 НК не состоятельна, если только не подавалась корректировка. Камералка идет 3 месяца. Как то сильно за пределами сроков.
Отвечайте на требование как описал выше.

Может в ответе указать:
При камеральной проверке расчета 6-НДФЛ налоговый орган проверяет, правильно ли вы заполнили отчетность.
Срок камеральной проверки - три месяца с даты, когда вы представили расчет 6-НДФЛ (п. 2 ст. 88 НК РФ).
Если вы правильно заполнили расчет 6-НДФЛ, у вас не вправе потребовать какие-либо дополнительные документы (п. 7 ст. 88 НК РФ). В этом случае налоговый орган проводит проверку на основании тех документов, которыми он располагает, и акт камеральной проверки не составляется (п. 5 ст. 88 НК РФ). Проверка считается оконченной по истечении трех месяцев.
Если же в расчете 6-НДФЛ есть ошибки, противоречия с другой отчетностью, налоговый орган вправе потребовать от вас пояснения или исправления расчета, а вы должны направить пояснения или исправить отчет в течение пяти рабочих дней (п. 6 ст. 6.1, п. 3 ст. 88 НК РФ).
Вместе с пояснениями или исправлениями вы можете представить в налоговый орган регистры налогового, бухгалтерского учета и другие документы, которые подтвердят достоверность указанных вами сведений (п. 4 ст. 88 НК РФ).
Если при камеральной проверке налоговый орган выявит неудержанную сумму НДФЛ, нарушения в сроках перечисления налога, другие правонарушения, за которые вас могут оштрафовать, то по проверке составят акт (п. 5 ст. 88, п. 1 ст. 100 НК РФ).
Как и при других камеральных проверках, акт составляется в течение 10 рабочих дней после окончания проверки. Вам его должны передать в течение пяти рабочих дней с момента составления (п. 6 ст. 6.1, п. п. 1, 5 ст. 100 НК РФ). Если вы не согласны с актом, в течение месяца с даты его получения вы можете подать свои письменные возражения (п. 6 ст. 100 НК РФ). После рассмотрения всех материалов выносится решение по проверке (п. 1 ст. 101 НК РФ).

Если посчитаете нужным подать корректировку, то…

Если в 6-НДФЛ вы не отразили какие-либо сведения или нашли ошибки, то нужно сдать уточненный расчет за тот же период (п. 6 ст. 81 НК РФ). Это могут быть ошибки в суммах доходов, вычетах, суммах налога, персональных данных работников и другие неточности. Также нужно представить уточненный расчет, если вы пересчитываете налог за истекший год.
Конкретных сроков для сдачи корректирующего расчета 6-НДФЛ нет. Его желательно подать до того, как ошибку найдет налоговый орган. Так вы сможете избежать штрафа за предоставление недостоверных сведений (п. 2 ст. 126.1 НК РФ).
Уточненный расчет нужно заполнить по форме, действовавшей в период, за который вносятся изменения (п. 5 ст. 81 НК РФ). Если вы уточняете расчет 6-НДФЛ за 2022 г., поданный по форме, действующей в том периоде, то он заполняется так:
• в строке “Номер корректировки” - “1–”, если исправляете расчет впервые, “2–” - если во второй раз и т.д. (п. 2.2 Порядка заполнения расчета 6-НДФЛ);
• в строках, где допустили ошибки, укажите верные значения вместо ошибочных.
В остальных строках расчета укажите те же данные, что и в первичном расчете.
Если в 6-НДФЛ вы неверно указали КПП или ОКТМО, то нужно также сдать уточненный расчет 6-НДФЛ. Но нужно заполнить и сдать в налоговый орган два расчета 6-НДФЛ с учетом следующего (Письмо ФНС России от 12.08.2016 N ГД-4-11/14772 (разъяснения даны в период действия прежней формы расчета 6-НДФЛ, однако, полагаем, они по-прежнему актуальны)):
• в одном расчете следует указать номер корректировки “0–”. В нем проставляют верные значения КПП или ОКТМО. Остальные строки переносят из первичного расчета;
• второй расчет подают с номером корректировки “1–”. КПП или ОКТМО указывают те же, что и в ошибочном отчете. Во всех разделах расчета проставляют нули.
Если в расчете 6-НДФЛ вы допустили ошибки в справках о доходах и суммах налога физлица, то в составе уточненного расчета за налоговый период надо представить корректирующие справки. Их необходимо заполнить в том же порядке, что и первичные, только указав правильные сведения. При этом в общей части корректирующей справки отразите (п. п. 5.1, 5.3 Порядка заполнения расчета 6-НДФЛ):
• в поле “Номер справки” - номер первичной справки, в которой были допущены ошибки;
• в поле “Номер корректировки сведений” - порядковый номер корректировки, например 01, если вносите изменения в справку впервые.
Если в 6-НДФЛ вы представили справку о доходах и суммах налога физлица ошибочно, то в составе уточненного расчета за налоговый период нужно подать аннулирующую справку. В ее общей части отразите (п. п. 5.1, 5.3 Порядка заполнения расчета 6-НДФЛ):
• в поле “Номер справки” - номер первичной справки, которую следует аннулировать;
• в поле “Номер корректировки сведений” - 99.
Полагаем, в аннулирующей справке в разд. 1 надо перенести данные из первичной справки, а разд. 2 - 4 и Приложение к справке не заполнять, поскольку такой порядок заполнения был установлен для формы 2-НДФЛ, которая похожа на действующую форму справки. За разъяснениями по данному вопросу рекомендуем обратиться в вашу инспекцию.