Здравствуйте!
Если речь о вычетах НДС, то принять к вычету можно при получении счета-фактуры и после завершения налогового периода, в котором эти товары (работы, услуги), имущественные права приняты на учет, но до срока представления налоговой декларации за указанный налоговый период. Т.е. до 25 июля в вашем случае.
Но у покупателя могут быть проблемы с принятием на учет, а именно документальным подтверждением, а соответственно с учетом расхода по налогу на прибыль, потому что 25 глава НК аналогичного положения не содержит, а по отпечатку ЭЦП будет видно, что документы отправлены в июле. И если по этим документам невозможно определить, что поставка была в июне, то у покупателя возможны споры с налоговыми органами.
Во избежание недовольства покупателей, возможно, имеет смысл пересмотреть процессы автоматизации.