Требование по НДС

Добрый день.
У нас ООО на ОСНО.
Пришло требование из ФНС о том, что наш поставщик не указал с\ф в декларации по НДС. Выяснили, что декларацию не сдали из-за ЭЦП и сейчас ко всему прочему у них недостоверность директора и учредителя. И эту проблему они будут долго разгребать долго, а нам вычеты снимут.
Но мы не включили в декларацию документ от другого поставщика, чтобы не было возмещения.
Сейчас я хочу убрать из первичной декларации счета - фактуры того поставщика, из-за которого пришло требование, и указать с\ф другого порставщика.
Подскажите, пожалуйста, как лучше объяснить налоговой эту манипуляцию.

А что тут объяснять? Или сдаете уточненку или предоставляете счета-фактуры проблемного поставщика с возмущением, что у вас всё верно, и пусть налоговая их наказывает