Как объяснить налоговой корректировку декларации по НДС?

Добрый день.
У нас ООО на ОСНО.
Пришло требование из ФНС о том, что наш поставщик не указал с\ф в декларации по НДС. Выяснили, что декларацию не сдали из-за ЭЦП и сейчас ко всему прочему у них недостоверность директора и учредителя. И эту проблему они будут долго разгребать долго, а нам вычеты снимут.
Но мы не включили в декларацию документ от другого поставщика, чтобы не было возмещения.
Сейчас я хочу убрать из первичной декларации счета - фактуры того поставщика, из-за которого пришло требование, и указать с\ф другого порставщика.
Подскажите, пожалуйста, как лучше объяснить налоговой эту манипуляцию.
И вообще, стоит ли сейчас что-то писать. Они написали: либо внесите изменения, либо пишите пояснения. Я просто исправлю декларацию.

Просто сдавайте корректировочный отчет с новой СФ вместо несуществующей.