Удержание ГСМ для личных нужд

При увольнении сотрудник не отчитался по расходу ГСМ за два месяца и написал заявление на удержание этой суммы из зп, как израсходованное в личных целях. Сотрудник ездил на своем автомобиле и заправлялся ГСМ по корпоративной топливной карте.
Нужно ли делать реализацию ГСМ сотруднику, начислять НДС и пробивать чеки?
Или достаточно удержать стоимость ГСМ с сотрудника и восстановить НДС принятый к вычету?

Добрый день!
Здесь нет реализации. Работник компенсирует работодателю убытки.
Согласно статье 1.1 Федерального закона от 22.05.2003 № 54-ФЗ под расчетами понимается, в частности, прием или выплата денежных средств наличными деньгами или в безналичном порядке за реализуемые товары, выполняемые работы, оказываемые услуги.
Погашение работником недостачи в форме удержания компанией из заработной платы работника – это не те расчеты, о которых говорится в Законе № 54-ФЗ. Если организация получает наличные денежные средства в результате совершения операций, не связанных с продажей товаров, выполнением работ или оказанием услуг, то она не должна применять ККТ (письмо МНС от 02.11.2004 № 33-0-09/691). (Смотрите также письма ФНС от 30.08.2019 № АС-4-20/17478@ и Минфина от 18.10.2019 № 03-01-15/80372).

Восстанавливать НДС в этом случае не нужно, даже если виновное лицо возместило Вам сумму ущерба с учетом НДС. В НК РФ такая обязанность не предусмотрена (письма Минфина от 27.01.2023 № 03-03-06/1/6428 и от 15.05.2019 № 03-07-11/34572).