У меня тоже так вышло.Узнала об этом запросив справку об отсутствии задолженности. Разбираюсь полтора месяца. Письма счастья (требования и решения о приостановлении операций по счетам) не приходили. Без уведомлений у меня приостановили операции по расчетному счету и снова взыскали уже уплаченный налог + пени. Теперь звонки и поход в налоговую для меня стали почти ежедневными.
Кроме того, начислили пеню по УСН. В ИФНС сказали что у них программа не видит платежи, если в платежках авансовый платеж был указан период КВ.01.2018, КВ.02.2018, КВ.03.2018 (годовой оплачен как ГД.2018). Нужно чтобы все авансовые платежи были с указанием периода ГД.2018). Раньше проблем с этим не было.