Налоги при продаже платит продавец.
В дальнейшем физ.лицо будучи собственником, будет платить земельный налог. и ( скорей всего) налог на имущество физ.лиц по сооружению.
Если вы начисляли амортизацию в НУ, то за 2018 организация переплатила налог.
Хорошая новость в том, что сейчас вам не надо будет пересчитывать единый налог и доплачивать его и пени.
Плохая-остаточной стоимости в НУ у вас всё равно нет, поэтому под налогообложение попадает вся сумма по сделке.
Плату нотариусу ( в пределах тарифов) можно учесть в расходах на основании пп.14 п.1 ст. 346.16 НК .